El claustro de mediodía resulta de gran belleza aunque de la época medieval solo se conserva una de las pandas, en concreto la que se une con la Basílica y que nació al unir el pórtico a la iglesia primitiva. El resto consta de dos plantas, la primera e estilo plateresco y data del siglo XVI fecha en que el abad Fonseca (1519-1524) mandó construir un nuevo claustro. La segunda planta neoclásica es fruto de una reconstrucción llevada a cabo en el primer tercio del siglo XVIII de la mano de Compostizo y de Domingo el portugués destacando por su friso decorado que contiene alusiones a las reinas de España.

 

Estilísticamente la arquería románica está compuesta por una galería abierta de cinco arcos, que recorría el muro norte del primitivo templo prolongándose hasta la muralla y que permaneció oculta desde el siglo XVI, momento de la construcción del nuevo claustro hasta que a en el primer cuarto del siglo XX el arquitecto Torbado lo descubriera.

 

La arquería que vemos hoy, restaurada en 1960 por Menéndez Pidal, consta de cuatro vanos en arco de doble rosca y uno más pequeño como ingreso enfrente de la puerta del templo; algunas piezas están rehechas, otras son originales. El pórtico remata en una cornisa y canecillos con cabezas de lobo, gemelos de los de la iglesia asturiana de San Pedro de Teverga. Los muros se levantaron con materiales reaprovechados y han aparecido entre ellos tejas que tienen impreso el sello de la Legio VII Gémina romana fundadora de la ciudad de León.

 

El Claustro se sigue utilizando por el pueblo de León para celebrar algunas de sus fiestas tradicionales como Las Cabezadas, el último domingo de abril, o la procesión del Domingo de Ramos y el rito de la Vigilia Pascual.Al claustro se abren diversas capillas, en la capilla de los Vaca, que se encuentra abierta al público, se encuentran dos elementos interesantes de la Colegiata.

 

El gallo veleta de la torre, realizado en cobre plomado recubierto de oro. Estudios efectuados por un comité interdisciplinar de expertos han demostrado que el polen hallado procedía del Golfo Pérsico, pues se trataba de un aguamanil que llegaría a León por medio de Al-Andalus probablemente como obsequio o tributo y cuya datación se remonta a finales del siglo VI.

 

También se puede contemplar una campana mozárabe, considerada la más antigua de España, pues fue fundida en 1086 y que algunos estudiosos consideran podría haber sido utilizada por el Cid.

 

La Torre se construye en tres fases: los dos primeros tramos son del siglo XI, es la parte cercana a la muralla, que se concibió como recinto de defensa. Los dos siguientes son del siglo XII y sirven de campanario. La cubierta es del siglo XVIII.